統率辦事處是民國3年5月9日成立的，由陸軍總長、海軍總長、參謀總長及大元帥特派的高級將領組織之。陸、海、參三部總長是當然辦事員，第一批所派的辦事員，隻有蔭昌、王士珍、薩鎮冰三人，其後加了蔡鍔等。這是袁把全國兵權從陸軍部抓迴自己手裏的一項具體措施。自從統率辦事處成立以來，總統府的軍事處也就取消了，段祺瑞退為辦事員之一，而陸軍部的重要職權都移轉到辦事處，陸軍部就成為一個名存實亡的機關了。
袁在宣統初奉“旨”養屙時，曾把價值30萬元的府學胡同私宅慷慨地贈給段祺瑞，段從那時起便住在這所房子內，在該宅辟一個側門以與陸軍部軍需司的走廊相通，經常由這門出入。自統率辦事處成立後，段就不大到部議公，一切部務都交由他所寵愛的門生——陸軍次長徐樹錚代拆代行。徐樹錚是段最親信的人，可是卻是袁所最討厭的人。
一次袁表示要把徐樹錚調職，段覺得這簡直是成心在找他的麻煩，因此沉不住氣大聲地說：“很好，請總統先免我的職，總統要怎麽辦，便怎麽辦！”
民國4年5月，正當日本提出廿一條的時候，陸軍部上了一道請求增加職員薪金的呈文，袁親筆批了如下的：“稍有人心，當不出此！”八個大字。由於段不到部辦公，自然對陸軍部公事也不看，有次袁問段某件公事，段說不知道，袁馬上正顏厲色地質問段：
“怎麽，剛剛我才看到陸軍部送來的公文，你是總長卻不知道？”廿一條簽署後，袁克定公開向人表示：所以要向日屈服，隻是因為中國不能抗日；為何不能抗日？因為陸軍不能作戰，陸軍部務無人負責，因此袁政府不能孤注一擲，冒險去抗日。在這種情況下，段終不得不向袁呈請辭職，並且不俟批準赴西山養屙。袁有意拉擾蔡鍔，準備讓入京不久的蔡鍔接任陸軍總長；後來還是決定仍給北洋的嫡係，於是陸軍總長一職便落在王士珍身上。
段祺瑞的請辭，當然是被迫的，但是他亦一直在病中，所以他請辭後即赴西山養屙，而袁則一再挽留，隻準段請假，一再給予延期，同時派王士珍代理，王因為不肯賣友，所以一再表示不肯就任陸軍總長。
民國4年5月31日袁才派王士珍署理陸軍總長，並發表明令給段祺瑞，給假兩月，頒人參四兩，醫藥費5000元。原令如下：
“前據陸軍總長段祺瑞呈稱：自去冬患病，飲食頓減，夜不成寐，迄至今春，遂致咯血，多方診治，時輕時重。醫言血虧氣鬱，脾弱肺熱，亟當靜養，服藥方能有效，迄今四月有餘，方值國家多故，未敢言病。現大局稍就平定，擬請開去差缺，俾得安心調理，冀獲速痊等情。當傳諭少給假期調養。茲據續請開去各項差缺，俾得安心調養，庶獲就痊等語。查自辛亥改革以來，該總長勳勞卓著，艱險備嚐。民國初建，憂患迭乘，數年經營，多資臂助，因而積勤致血衰氣弱，形容羸削，迭於會議之時麵諭該總長酌於一星期抽兩三日赴西山等處清靜地方調養休息，以期氣體複強，而該總長以國事為重，仍不肯稍就暇逸，盡瘁國事，殊堪嘉敬。茲據呈請開缺，情詞肫摯，本大總統為國家愛惜人才，未便聽其過勞，致增病勢，特著給假兩個月，並頒給人參四兩，醫藥費五千元，以資攝衛。該總長務以時局多艱為念，善自珍重，並慎延名醫，詳察病源，多方施治，切望早日就痊，立即銷假。其在假期內如有軍務重要事件，仍著隨時入內會議，以抒嘉謨而裨國計。此令！”
段正式解除陸軍總長職務是這年的8月29日，與這命令同時公布的，是由王士珍接受段的陸軍總長遺缺。段離職後，袁又指使肅政廳彈劾徐樹錚訂購外軍火浮報40萬元，並於6月26日免去他陸軍次長職，以田中玉繼任。袁段之間由於段的病假，袁的明令給假種種而惹起滿天風雨，爭傳袁段正式決裂，因為所有跡象都顯現兩人之間有問題，袁越做作，越啟人疑竇。8月3日段發表通電闢謠：
“廿年前大總統在小站練兵時，祺瑞以一武備學生充下級武秩，與大總統素無關係，乃承采及虛聲，立委為炮隊統帶，升任統製，不數年由千總微秩，擢道員、總兵、副都統各職。及大總統東山再起，祺瑞複見任湖廣總督、陸軍總長各職，以大總統知祺瑞之深，信祺瑞之堅，遇祺瑞之厚，殆無可加。是以感恩知己，數十年如一目，分雖部下，情逾骨肉。近數年來，祺瑞因吐血失眠，籲懇息肩，乃包藏禍心之某國報紙，以挑撥離間之詭計，直欲誣祺瑞為忘恩負義之徒，甚至偽造被人行刺之謠，更屬毫無影響，不得不略表心跡以息訛言。”
中國官場向是謠言越辟越真，段所謂行刺及某國報紙，原來是這樣的：陸軍部曾發生茶役偷置炸彈案，日本報紙指為是袁欲謀殺段的政治陰謀。
北洋軍人都認定袁、段分家的導火線是袁克定編練“模範團”觸發的。自袁小站練兵起，他即積極抓緊軍隊，不過自他當總統後，已沒有更多時間全神貫注於軍隊，北洋軍人多是段的學生和部屬，下級軍官幾乎全是段所培植，因此，段在北洋係中的勢力便漸漸抬頭。加以馮國璋調往南京後，中央全國軍事完全由段統率，在北洋係中馮段可說是勢均力敵，現在段卻超過了馮，馮心中自然很不高興。因此袁克定主張把兵權拿在自己手中，同時另創一支生力軍，馮是從旁極力推動的。
在大元帥統率辦事處未成立時，袁克定便經常和德國的丁克滿少校，法國的白禮蘇中校討論軍事學和訓練新軍的問題。為了成立一支更新的新軍（20年前袁世凱在小站練兵時，即是為了建立新軍；新軍經過20年，已變成了舊軍了），袁克定向袁建議，在統率辦事處下麵成立一個模範軍，由大元帥兼模範軍軍長，這個計劃和清末宣統年間攝政王載灃集中兵權於皇室中央，組織禁衛軍而自為統帥一樣。模範軍預定先成立兩個模範師，中級軍官盡量用留學生，下級軍官則用軍官生和速成生。
原來北洋軍的軍官來源，多是天津武備學堂和北洋各軍事學堂的畢業生，這些學堂一直是段祺瑞負責。袁克定籌編新軍計劃中，軍官來源改用保定軍官學校和陸軍速成學校的畢業生。保定軍官學校和天津武備學堂一樣，都是在清末創立的，袁不願段多樹力量，保定軍官學校的校長總是親袁派，一次他未經和段商量，便派蔣方震為校長，因此保定軍官學校的經費種種，多受到陸軍部的留難。蔣方震不勝其煩，竟在校長任內自殺，幸被搶救但堅決求去。袁乃改派蔣為總統府軍事參議，段這時還兼總統府軍事處長，餘恚猶在，竟拒發委任狀，蔣遂不能到差。
袁不願太刺激段和一般北洋舊人，因此把模範軍縮小為模範團，模範團的性質與規模都和模範軍不同，它好像是一個軍官訓練班的擴大，派王士珍為模範團籌備處處長，直隸於統率辦事處。用北方人又是北洋宿將來籌備，是袁避免引起北洋舊人的反感。
民國3年10月23日正式成立模範團，團址設在西城旃檀寺，袁世凱自兼團長，以曾任赤峰鎮守使的陳光遠為團副，王士珍、袁克定、張敬堯、陳光遠為辦事員，團本部設在北海。模範團的成立最使段祺瑞不愉快，最明顯的是袁家父子不放心段在北洋軍中的堅固力量，因此另立新軍以代替北洋軍。可是，袁以北洋軍為本錢起家，如今天下還未完全底定，即欲取消北洋軍，這是袁一生最失策之處。
</br>
袁在宣統初奉“旨”養屙時，曾把價值30萬元的府學胡同私宅慷慨地贈給段祺瑞，段從那時起便住在這所房子內，在該宅辟一個側門以與陸軍部軍需司的走廊相通，經常由這門出入。自統率辦事處成立後，段就不大到部議公，一切部務都交由他所寵愛的門生——陸軍次長徐樹錚代拆代行。徐樹錚是段最親信的人，可是卻是袁所最討厭的人。
一次袁表示要把徐樹錚調職，段覺得這簡直是成心在找他的麻煩，因此沉不住氣大聲地說：“很好，請總統先免我的職，總統要怎麽辦，便怎麽辦！”
民國4年5月，正當日本提出廿一條的時候，陸軍部上了一道請求增加職員薪金的呈文，袁親筆批了如下的：“稍有人心，當不出此！”八個大字。由於段不到部辦公，自然對陸軍部公事也不看，有次袁問段某件公事，段說不知道，袁馬上正顏厲色地質問段：
“怎麽，剛剛我才看到陸軍部送來的公文，你是總長卻不知道？”廿一條簽署後，袁克定公開向人表示：所以要向日屈服，隻是因為中國不能抗日；為何不能抗日？因為陸軍不能作戰，陸軍部務無人負責，因此袁政府不能孤注一擲，冒險去抗日。在這種情況下，段終不得不向袁呈請辭職，並且不俟批準赴西山養屙。袁有意拉擾蔡鍔，準備讓入京不久的蔡鍔接任陸軍總長；後來還是決定仍給北洋的嫡係，於是陸軍總長一職便落在王士珍身上。
段祺瑞的請辭，當然是被迫的，但是他亦一直在病中，所以他請辭後即赴西山養屙，而袁則一再挽留，隻準段請假，一再給予延期，同時派王士珍代理，王因為不肯賣友，所以一再表示不肯就任陸軍總長。
民國4年5月31日袁才派王士珍署理陸軍總長，並發表明令給段祺瑞，給假兩月，頒人參四兩，醫藥費5000元。原令如下：
“前據陸軍總長段祺瑞呈稱：自去冬患病，飲食頓減，夜不成寐，迄至今春，遂致咯血，多方診治，時輕時重。醫言血虧氣鬱，脾弱肺熱，亟當靜養，服藥方能有效，迄今四月有餘，方值國家多故，未敢言病。現大局稍就平定，擬請開去差缺，俾得安心調理，冀獲速痊等情。當傳諭少給假期調養。茲據續請開去各項差缺，俾得安心調養，庶獲就痊等語。查自辛亥改革以來，該總長勳勞卓著，艱險備嚐。民國初建，憂患迭乘，數年經營，多資臂助，因而積勤致血衰氣弱，形容羸削，迭於會議之時麵諭該總長酌於一星期抽兩三日赴西山等處清靜地方調養休息，以期氣體複強，而該總長以國事為重，仍不肯稍就暇逸，盡瘁國事，殊堪嘉敬。茲據呈請開缺，情詞肫摯，本大總統為國家愛惜人才，未便聽其過勞，致增病勢，特著給假兩個月，並頒給人參四兩，醫藥費五千元，以資攝衛。該總長務以時局多艱為念，善自珍重，並慎延名醫，詳察病源，多方施治，切望早日就痊，立即銷假。其在假期內如有軍務重要事件，仍著隨時入內會議，以抒嘉謨而裨國計。此令！”
段正式解除陸軍總長職務是這年的8月29日，與這命令同時公布的，是由王士珍接受段的陸軍總長遺缺。段離職後，袁又指使肅政廳彈劾徐樹錚訂購外軍火浮報40萬元，並於6月26日免去他陸軍次長職，以田中玉繼任。袁段之間由於段的病假，袁的明令給假種種而惹起滿天風雨，爭傳袁段正式決裂，因為所有跡象都顯現兩人之間有問題，袁越做作，越啟人疑竇。8月3日段發表通電闢謠：
“廿年前大總統在小站練兵時，祺瑞以一武備學生充下級武秩，與大總統素無關係，乃承采及虛聲，立委為炮隊統帶，升任統製，不數年由千總微秩，擢道員、總兵、副都統各職。及大總統東山再起，祺瑞複見任湖廣總督、陸軍總長各職，以大總統知祺瑞之深，信祺瑞之堅，遇祺瑞之厚，殆無可加。是以感恩知己，數十年如一目，分雖部下，情逾骨肉。近數年來，祺瑞因吐血失眠，籲懇息肩，乃包藏禍心之某國報紙，以挑撥離間之詭計，直欲誣祺瑞為忘恩負義之徒，甚至偽造被人行刺之謠，更屬毫無影響，不得不略表心跡以息訛言。”
中國官場向是謠言越辟越真，段所謂行刺及某國報紙，原來是這樣的：陸軍部曾發生茶役偷置炸彈案，日本報紙指為是袁欲謀殺段的政治陰謀。
北洋軍人都認定袁、段分家的導火線是袁克定編練“模範團”觸發的。自袁小站練兵起，他即積極抓緊軍隊，不過自他當總統後，已沒有更多時間全神貫注於軍隊，北洋軍人多是段的學生和部屬，下級軍官幾乎全是段所培植，因此，段在北洋係中的勢力便漸漸抬頭。加以馮國璋調往南京後，中央全國軍事完全由段統率，在北洋係中馮段可說是勢均力敵，現在段卻超過了馮，馮心中自然很不高興。因此袁克定主張把兵權拿在自己手中，同時另創一支生力軍，馮是從旁極力推動的。
在大元帥統率辦事處未成立時，袁克定便經常和德國的丁克滿少校，法國的白禮蘇中校討論軍事學和訓練新軍的問題。為了成立一支更新的新軍（20年前袁世凱在小站練兵時，即是為了建立新軍；新軍經過20年，已變成了舊軍了），袁克定向袁建議，在統率辦事處下麵成立一個模範軍，由大元帥兼模範軍軍長，這個計劃和清末宣統年間攝政王載灃集中兵權於皇室中央，組織禁衛軍而自為統帥一樣。模範軍預定先成立兩個模範師，中級軍官盡量用留學生，下級軍官則用軍官生和速成生。
原來北洋軍的軍官來源，多是天津武備學堂和北洋各軍事學堂的畢業生，這些學堂一直是段祺瑞負責。袁克定籌編新軍計劃中，軍官來源改用保定軍官學校和陸軍速成學校的畢業生。保定軍官學校和天津武備學堂一樣，都是在清末創立的，袁不願段多樹力量，保定軍官學校的校長總是親袁派，一次他未經和段商量，便派蔣方震為校長，因此保定軍官學校的經費種種，多受到陸軍部的留難。蔣方震不勝其煩，竟在校長任內自殺，幸被搶救但堅決求去。袁乃改派蔣為總統府軍事參議，段這時還兼總統府軍事處長，餘恚猶在，竟拒發委任狀，蔣遂不能到差。
袁不願太刺激段和一般北洋舊人，因此把模範軍縮小為模範團，模範團的性質與規模都和模範軍不同，它好像是一個軍官訓練班的擴大，派王士珍為模範團籌備處處長，直隸於統率辦事處。用北方人又是北洋宿將來籌備，是袁避免引起北洋舊人的反感。
民國3年10月23日正式成立模範團，團址設在西城旃檀寺，袁世凱自兼團長，以曾任赤峰鎮守使的陳光遠為團副，王士珍、袁克定、張敬堯、陳光遠為辦事員，團本部設在北海。模範團的成立最使段祺瑞不愉快，最明顯的是袁家父子不放心段在北洋軍中的堅固力量，因此另立新軍以代替北洋軍。可是，袁以北洋軍為本錢起家，如今天下還未完全底定，即欲取消北洋軍，這是袁一生最失策之處。
</br>