“有機晶體請下dc庫,無機晶體下載iscd庫,兩者都是免費,設定完畢,開始自動演算……”
李驍設定好數模程序,與劍橋結構數據庫鏈接上,看著電腦屏幕上不斷閃現一串串的數據——
pages of publication 1106
a 8.627 ± 0.008 ?
b 9.035 ± 0.006 ?
c 13.469 ± 0.008 ?
a 90°
β 101.92 ± 0.05°
γ 90°
cell volume 1027.2 ± 1.3 ?3
cell temperature 173 ± 2 k
……
距離得到《理『性』分子設計》已經過去了三周,這三周他每天都在與這頭攔路虎死磕,先是研究這個方法的原理,然後開始設計數模算法、編製程序,再在電腦上嚐試運行,結果發現破舊的二手電腦根本就跑不起來。
無奈他幹脆花了十幾萬買了一台專業服務器,搭載好平台後,先後鏈接了美國蛋白質結構數據庫、化學品目錄數據庫、劍橋結構數據庫,進行檢索演算。
其中,劍橋結構數據庫含有875,000個有機及金屬有機化合物的x『射』線和中子『射』線衍『射』的分析數據;美國蛋白質結構數據庫包含超過51, 000 個蛋白質的三維結構信息。
這兩者都是李驍優先用算法進行檢索的目標數據庫。
可惜數據太過龐大,即便以十幾萬的專業服務器而言,也需要一定時間的演算才能有結果。
『揉』了『揉』眉心,倍感疲勞的他給自己又衝了一杯咖啡,腦袋靠在椅子靠背上,看著電腦屏幕上掠過的一行行數據,思緒不由得飄『蕩』了起來……
目前演算完成度已經達到了91%,與目標酶的結構契合最高的已知酶結構達到了95%,這個結果已經讓他比較滿意了,雖然不是100%,但以95%契合度的已知酶進行研究,直至找到100%契合的酶結構,也會減小不小的工作量。
當然,如果走了狗屎運的話,就是直接找到100%契合度的酶結構,說明人類已經發現了這種酶,隻是不知道它可以應用在炎『性』肌細胞的dna裂解上。
在這種最理想的狀態下,直接把這種酶購買過來,進行實驗就可以了!
“嗬嗬,我在想什麽呢?100%吻合的酶結構,怎麽可能?”李驍苦笑打消了這個不切實際的想法,心想:“還有9%的數據還未檢索完成,如果能在95%的基礎上再提升一些就更好了!”
“可惜我的數學和化學等級還是有點低了,要是能再升一級就好了。”他搖了搖頭,有些感歎。
越是對基因的微觀世界進行深入研究,越是發現數學、物理和化學的作用不可小覷。
數學有助於對現有數據進行分析、建立數學模型、構建算法,指明研究方向,是一種強大的理論工具。數學弱就是盲人騎瞎馬,到處『亂』撞,甚至有可能研究的方向都是錯誤的。
化學和物理是兩隻拐杖,提供了強大的實驗工具支持,微觀基因研究都是分子層麵,需要借助很多化學和物理的手段才能進行實驗,這兩者弱就像沒了兩隻拐杖,就算知道方向在哪裏,走起來也是跌跌撞撞的。
計算機編程能力就更不用說了,工欲善其事必先利其器,如果李驍不是計算機係的高材生,怎麽可能僅僅用了一周就搭建起服務器平台,調試好了數模程序呢?
這就好像是一把鋒利的砍刀,讓李驍能披荊斬棘,前進的道路上走得更順暢……
……
“不是你親手點燃的,那就不能叫做火焰!不是你親手『摸』過的,那就不能叫做寶石!”
就在李驍有些感慨的時候,手機響起,他連忙按下接聽鍵。
唐教授洪亮的嗓音響起,帶著些許的焦急:“喂!李驍啊!今天都8月31日了,報名的截止日,你怎麽還沒上igem官網報名啊?還有你說的讚助商聯係上了沒?趕緊讓人家過來一趟,把合同簽了,沒有資金項目怎麽開展啊?”
李驍一拍腦門,最近忙得焦頭爛額,把這兩件要緊事給忙忘了,連忙道:“老師您放心,我今天肯定把這兩件事辦妥。”
“好好,你可千萬別忘了,有什麽難處跟我說,你作為隊長一定要擔起責任來!”
“放心吧老師,我一會就弄報名,下午聯係好讚助商,我就去學校一趟,最近一直在弄裂解酶的研究,實在是忙昏頭了!”李驍不好意思地道,他聽出了唐教授語氣中的不放心。
唐國軒一聽來了興趣,連忙問道:“裂解酶的研究?難道你已經找到了能剪切炎『性』肌細胞dna的裂解酶了?”
“還沒有,隻是用‘理『性』分子設計’設計了個數模體係,正用程序在商業數據庫上抓數據分析呢!”李驍不好意思地道。
唐國軒一聽卻是倒吸一口氣,理『性』分子設計可是最近才興起的分析手段,沒有強大的數學和計算機能力,根本就玩不轉的,就連他也涉獵不多,即便要做也得拜托數學係的教授幫忙。
現在一聽李驍貿然進了這麽個大坑,唐國軒可有些著急了,連忙問道:“你有沒有把握啊?進展到什麽程度了?連接的是什麽商業數據庫?”
“還算順利,老師。程序已經跑了快有兩周了,連接的是三個商業數據庫——美國蛋白質結構數據庫、化學品目錄數據庫、劍橋結構數據庫。”李驍不緊不慢地道。
唐國軒卻是聽得兩眼有些發直,他還以為李驍鏈接的是國內的那些偏小的數據庫,沒想到這小子竟然直接跟國際知名大數據庫幹上了,而且一下就鏈接了三台,那運算的複雜程度和運算量……
一想到這裏,他焦急地道:“這三個商業數據庫都是國際級的,沒有專業服務器根本跑不起來程序,你程序是怎麽搭載的?”
“放心吧老師,投資商已經給我投了一台十幾萬的專業服務器,目前運行兩周還算穩定,如果不夠用,他們還會給我再投一台更好的。”李驍鎮定地道。
他現在可是手握200萬,真要是『逼』急眼了,砸個100萬買台更好的服務器不在話下,隻是眼下還沒到那程度。
“那好吧!你小子不聲不響竟然搞出那麽大動靜來,我都不知道說啥了!”唐國軒笑罵道:“下午兩點滾過來一趟,讓你聯係的投資商趕緊把合同簽了,順便你給我把項目進展匯報匯報,還有團隊成員也得叫到一起開個會了,下個月就是項目正式啟動了!”
“得嘞。”李驍電話裏幹脆地迴答。
掛了電話,唐國軒看了一眼旁邊坐著的王教授和張教授。
張教授問道:“怎麽樣了?李驍的項目進展到什麽程度了?”
“這小子心裏有數著呢!下午兩點他會帶著投資商過來簽合同,行不行咱們當麵問問他不就知道了嘛!”唐國軒喝了口茶水,鎮定地迴答。
原來三周過去,李驍一直閉門搞研究,團隊沒有任何動靜,計算機係的劉成和宋鑫心裏有點犯嘀咕,就找到張教授,想讓他試探一下這邊的意思,如果項目有什麽變化,倆人也好另有打算。
事實上,王教授那邊項目已經風風火火地展開了,進展異常順利,不過團隊在計算機方麵有點薄弱,便想把劉成和宋鑫兩人給挖過去。
兩位教授私下裏已經碰過,達成了共識,打算來探探唐國軒的虛實,如果證明李驍這個團隊沒有『操』作價值,那張教授就會讓劉成和宋鑫退出,趁著報名截止之前加入王聰的團隊。
唐國軒如何不知道兩人的心思,此時雖然表麵鎮定,心裏也有些犯嘀咕:“李驍啊李驍,下午兩點你要是不能帶著讚助商過來簽合同,項目拿不出具體的規劃來,那我也保不住你了!”
李驍設定好數模程序,與劍橋結構數據庫鏈接上,看著電腦屏幕上不斷閃現一串串的數據——
pages of publication 1106
a 8.627 ± 0.008 ?
b 9.035 ± 0.006 ?
c 13.469 ± 0.008 ?
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β 101.92 ± 0.05°
γ 90°
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cell temperature 173 ± 2 k
……
距離得到《理『性』分子設計》已經過去了三周,這三周他每天都在與這頭攔路虎死磕,先是研究這個方法的原理,然後開始設計數模算法、編製程序,再在電腦上嚐試運行,結果發現破舊的二手電腦根本就跑不起來。
無奈他幹脆花了十幾萬買了一台專業服務器,搭載好平台後,先後鏈接了美國蛋白質結構數據庫、化學品目錄數據庫、劍橋結構數據庫,進行檢索演算。
其中,劍橋結構數據庫含有875,000個有機及金屬有機化合物的x『射』線和中子『射』線衍『射』的分析數據;美國蛋白質結構數據庫包含超過51, 000 個蛋白質的三維結構信息。
這兩者都是李驍優先用算法進行檢索的目標數據庫。
可惜數據太過龐大,即便以十幾萬的專業服務器而言,也需要一定時間的演算才能有結果。
『揉』了『揉』眉心,倍感疲勞的他給自己又衝了一杯咖啡,腦袋靠在椅子靠背上,看著電腦屏幕上掠過的一行行數據,思緒不由得飄『蕩』了起來……
目前演算完成度已經達到了91%,與目標酶的結構契合最高的已知酶結構達到了95%,這個結果已經讓他比較滿意了,雖然不是100%,但以95%契合度的已知酶進行研究,直至找到100%契合的酶結構,也會減小不小的工作量。
當然,如果走了狗屎運的話,就是直接找到100%契合度的酶結構,說明人類已經發現了這種酶,隻是不知道它可以應用在炎『性』肌細胞的dna裂解上。
在這種最理想的狀態下,直接把這種酶購買過來,進行實驗就可以了!
“嗬嗬,我在想什麽呢?100%吻合的酶結構,怎麽可能?”李驍苦笑打消了這個不切實際的想法,心想:“還有9%的數據還未檢索完成,如果能在95%的基礎上再提升一些就更好了!”
“可惜我的數學和化學等級還是有點低了,要是能再升一級就好了。”他搖了搖頭,有些感歎。
越是對基因的微觀世界進行深入研究,越是發現數學、物理和化學的作用不可小覷。
數學有助於對現有數據進行分析、建立數學模型、構建算法,指明研究方向,是一種強大的理論工具。數學弱就是盲人騎瞎馬,到處『亂』撞,甚至有可能研究的方向都是錯誤的。
化學和物理是兩隻拐杖,提供了強大的實驗工具支持,微觀基因研究都是分子層麵,需要借助很多化學和物理的手段才能進行實驗,這兩者弱就像沒了兩隻拐杖,就算知道方向在哪裏,走起來也是跌跌撞撞的。
計算機編程能力就更不用說了,工欲善其事必先利其器,如果李驍不是計算機係的高材生,怎麽可能僅僅用了一周就搭建起服務器平台,調試好了數模程序呢?
這就好像是一把鋒利的砍刀,讓李驍能披荊斬棘,前進的道路上走得更順暢……
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“不是你親手點燃的,那就不能叫做火焰!不是你親手『摸』過的,那就不能叫做寶石!”
就在李驍有些感慨的時候,手機響起,他連忙按下接聽鍵。
唐教授洪亮的嗓音響起,帶著些許的焦急:“喂!李驍啊!今天都8月31日了,報名的截止日,你怎麽還沒上igem官網報名啊?還有你說的讚助商聯係上了沒?趕緊讓人家過來一趟,把合同簽了,沒有資金項目怎麽開展啊?”
李驍一拍腦門,最近忙得焦頭爛額,把這兩件要緊事給忙忘了,連忙道:“老師您放心,我今天肯定把這兩件事辦妥。”
“好好,你可千萬別忘了,有什麽難處跟我說,你作為隊長一定要擔起責任來!”
“放心吧老師,我一會就弄報名,下午聯係好讚助商,我就去學校一趟,最近一直在弄裂解酶的研究,實在是忙昏頭了!”李驍不好意思地道,他聽出了唐教授語氣中的不放心。
唐國軒一聽來了興趣,連忙問道:“裂解酶的研究?難道你已經找到了能剪切炎『性』肌細胞dna的裂解酶了?”
“還沒有,隻是用‘理『性』分子設計’設計了個數模體係,正用程序在商業數據庫上抓數據分析呢!”李驍不好意思地道。
唐國軒一聽卻是倒吸一口氣,理『性』分子設計可是最近才興起的分析手段,沒有強大的數學和計算機能力,根本就玩不轉的,就連他也涉獵不多,即便要做也得拜托數學係的教授幫忙。
現在一聽李驍貿然進了這麽個大坑,唐國軒可有些著急了,連忙問道:“你有沒有把握啊?進展到什麽程度了?連接的是什麽商業數據庫?”
“還算順利,老師。程序已經跑了快有兩周了,連接的是三個商業數據庫——美國蛋白質結構數據庫、化學品目錄數據庫、劍橋結構數據庫。”李驍不緊不慢地道。
唐國軒卻是聽得兩眼有些發直,他還以為李驍鏈接的是國內的那些偏小的數據庫,沒想到這小子竟然直接跟國際知名大數據庫幹上了,而且一下就鏈接了三台,那運算的複雜程度和運算量……
一想到這裏,他焦急地道:“這三個商業數據庫都是國際級的,沒有專業服務器根本跑不起來程序,你程序是怎麽搭載的?”
“放心吧老師,投資商已經給我投了一台十幾萬的專業服務器,目前運行兩周還算穩定,如果不夠用,他們還會給我再投一台更好的。”李驍鎮定地道。
他現在可是手握200萬,真要是『逼』急眼了,砸個100萬買台更好的服務器不在話下,隻是眼下還沒到那程度。
“那好吧!你小子不聲不響竟然搞出那麽大動靜來,我都不知道說啥了!”唐國軒笑罵道:“下午兩點滾過來一趟,讓你聯係的投資商趕緊把合同簽了,順便你給我把項目進展匯報匯報,還有團隊成員也得叫到一起開個會了,下個月就是項目正式啟動了!”
“得嘞。”李驍電話裏幹脆地迴答。
掛了電話,唐國軒看了一眼旁邊坐著的王教授和張教授。
張教授問道:“怎麽樣了?李驍的項目進展到什麽程度了?”
“這小子心裏有數著呢!下午兩點他會帶著投資商過來簽合同,行不行咱們當麵問問他不就知道了嘛!”唐國軒喝了口茶水,鎮定地迴答。
原來三周過去,李驍一直閉門搞研究,團隊沒有任何動靜,計算機係的劉成和宋鑫心裏有點犯嘀咕,就找到張教授,想讓他試探一下這邊的意思,如果項目有什麽變化,倆人也好另有打算。
事實上,王教授那邊項目已經風風火火地展開了,進展異常順利,不過團隊在計算機方麵有點薄弱,便想把劉成和宋鑫兩人給挖過去。
兩位教授私下裏已經碰過,達成了共識,打算來探探唐國軒的虛實,如果證明李驍這個團隊沒有『操』作價值,那張教授就會讓劉成和宋鑫退出,趁著報名截止之前加入王聰的團隊。
唐國軒如何不知道兩人的心思,此時雖然表麵鎮定,心裏也有些犯嘀咕:“李驍啊李驍,下午兩點你要是不能帶著讚助商過來簽合同,項目拿不出具體的規劃來,那我也保不住你了!”