需要的關鍵數據不出來，小白鼠基因功能演化模擬就無法繼續進行，曾凡也不好整天去各個小組催促，就像理查德所說，有些實驗著急也沒用，必須要有耐心。
習慣了忙碌的狀態，偶然清閑下來，曾凡總會有無所適從的感覺。
從實驗室出來，他決定去貝拉農場，自己的實驗室，想做什麽自由度更高。
他們的新型超算出乎意料的受歡迎，加上貝拉農場的實驗室進行噬菌體和酵母菌的研究對算力要求不太大，細胞一號就沒有進行升級，準備等基因二號芯片出來後直接升級更高算力。
除了以噬菌體為基因載體進行殺菌研究外，布萊頓和黛西也在研究探索更好的對基因進行編輯的方法，現有的手段太過複雜繁瑣，成功率還很低，改造一個最簡單的rna片段都費盡周折，更別說編輯複雜千萬倍的基因序列了。
他們目前能使用的方法太過簡陋，好像用公元前的冶鐵方式，想要建造一艘萬噸巨輪一樣，簡直就是癡心妄想。
曾凡開著野馬直接到了實驗室樓下，實驗室共有七層，頂層是超算機房，布萊頓的實驗室和辦公室都在在二樓。
進入他辦公室的時候，布萊頓正坐在辦公桌前的椅子上，麵對著窗台上一盆仙人掌在發呆，亂糟糟的頭發和胡子不知道多久沒有打理了。
“布萊頓教授，有什麽進展嗎？”曾凡拉過一把椅子，坐在他的辦公桌旁邊。
“沒有，我們的設想很好，理論上麵也沒問題，隻是目前還沒有找到正確的方式，不知道什麽時候能成功！”布萊頓對他到來一點也不奇怪，繼續盯著仙人掌發呆。
曾凡的設想就是改造出一種噬菌體，作為基因剪刀，利用它們的自有能力，攜帶指定的基因片段，插入想要編輯的目標基因組中。
噬菌體按照對細菌的殺傷力分為毒性噬菌體和溫和型噬菌體，毒性噬菌體進入所克製的細菌體內就會瘋狂的自我複製，達到一定數量就會分解一種酶，裂解宿主細菌；溫和型噬菌體不同，進入宿主細菌後，會將自身基因整合到細菌染色體上，跟隨細菌一起繁殖，在達到某些特定條件才會裂解宿主細菌，重新尋找宿主。
他們的設想就是利用這種溫和型噬菌體的特性，進行基因插入，從而實現對目標基因組的編輯。
可是噬菌體都是專門針對某一類細菌進行入侵，體型太小，想將固定基因和它們融合也很難，尤其是後麵一個難點，布萊頓研究半年也沒找到一個好辦法。
麵前的桌子上放著厚厚一摞文件夾，曾凡隨手拿起最上麵一本翻看，是一本實驗記錄。
布萊頓的一個助手進行的一次新型噬菌體實驗，他們在研究一種針對藍莓樹致病細菌的噬菌體，這次實驗以失敗告終，這種噬菌體入侵目標細菌後並不能大量繁殖，反而是肉包子打狗，有去無迴。
在顯微鏡下的觀察顯示，這些噬菌體進入目標細菌後，自身基因被某種物質切斷，等於被人家打了埋伏，一進去就被消滅掉了。
尤其是電鏡拍攝的照片顯示，噬菌體的堿基序列被切斷的位置非常整齊，都在某一個固定的位置被切斷，好像是一群被斬首示眾的土匪。
“布萊頓教授，這次實驗前在細胞一號上麵進行過模擬驗證嗎？”曾凡將實驗記錄放到他麵前問道。
“這是臨時增加的實驗，沒有進行驗證，不過我們做過這種病菌的基因組測序，進行驗證難度不大，這報告有什麽不對嗎？”布萊頓問道。
“病菌能將噬菌體基因在同一位置切斷，那麽它們應該有方法判斷噬菌體的基因序列，然後才好下刀，這不正是我們需要的剪刀嗎？”
他的話瞬間引起布萊頓的興趣，拿起文件夾仔細觀察那些拍攝的照片，越看越覺得曾凡說的有道理，然後拿著文件夾急匆匆跑了出去。
“瑞恩！瑞恩！五十九號實驗的樣品還在嗎？”布萊頓出門跑到不遠的一間實驗室喊道。
“教授，剛剛處理完！”一頭棕色自然卷發型的年輕助手聳聳肩迴答道。
“那你重新準備材料，重複這個實驗，最後的照片多拍幾張，看看結果是不是相同！”布萊頓吩咐道。
“遵命，先生！”
隨後，布萊頓拉著曾凡乘電梯上頂樓的機房，準備進行一次這個實驗的演化模擬，看看能不能複現實驗中的情況。
機房中一身白大褂的黛西正坐在超算控製台前麵觀看屏幕上的模擬畫麵，整天觀看類似畫麵的曾凡一眼就看出這是什麽場景。
這是細胞分裂的場景，她們不是一直在研究病菌和噬菌體嗎，怎麽研究起多細胞生物了，曾凡有點納悶，這種演化模擬都很費時間。
“黛西，你的牛皮蠅模擬還要多長時間？我們要做五十九號實驗演化模擬！”布萊頓拉開椅子坐在她身邊。
“我也不知道，才剛開始一天，還在胚胎發育期，我可以暫停讓給你先做！”黛西轉頭看見曾凡站在身後，笑著打招唿。
“曾，你可是有一個月沒過來了！我們的細胞一號什麽時候升級？”
“基因二號芯片量產出來就升級，下個月應該差不多了，我們實驗室當然要擁有最強超算！”曾凡迴答道。
畢業於普林斯頓的黛西今年三十二歲，留校當了三年助教，去年評副教授失敗，經過帕米拉的介紹來到貝拉農場實驗室，繼續自己的研究。
曾凡將黛西當前的模擬程序暫停存盤，然後根據布萊頓的提示操作調出實驗菌的基因組序列，使用工具軟件進行演化程序製作。
為了方便他們進行不同菌種的演化模擬，曾凡專門改寫了個工具軟件，隻要有細菌或者噬菌體的基因組序列，就能根據已知數據自動生成模擬程序，極大的降低了他們自己操作的難度。
曾凡沒時間總在這裏，薛燕開學後也隻有周末能過來，有了這個工具軟件，他們就方便多了，每次實驗前先進行幾次模擬，效率能提高很多。
“黛西，你這個模擬程序也是用工具軟件自動生成的嗎？”曾凡好奇的問，這個軟件是在之前的基礎上進行了專門對細菌微生物的優化，牛皮蠅這種他見都沒見過的物種不知道準確度能有多少。
“是啊，你寫的工具軟件挺好用，這麽複雜的昆蟲一個多小時程序就完成了，我添加了一些特征參數就開始演化模擬，今天一整天都沒有出錯，可能有你之前果蠅的模擬的數據積累吧，畢竟都是蠅類！”黛西說道。
細菌類單細胞生物基因組都很簡單，生成速度很快，幾分鍾就完成了，立刻開始演化模擬。
習慣了忙碌的狀態，偶然清閑下來，曾凡總會有無所適從的感覺。
從實驗室出來，他決定去貝拉農場，自己的實驗室，想做什麽自由度更高。
他們的新型超算出乎意料的受歡迎，加上貝拉農場的實驗室進行噬菌體和酵母菌的研究對算力要求不太大，細胞一號就沒有進行升級，準備等基因二號芯片出來後直接升級更高算力。
除了以噬菌體為基因載體進行殺菌研究外，布萊頓和黛西也在研究探索更好的對基因進行編輯的方法，現有的手段太過複雜繁瑣，成功率還很低，改造一個最簡單的rna片段都費盡周折，更別說編輯複雜千萬倍的基因序列了。
他們目前能使用的方法太過簡陋，好像用公元前的冶鐵方式，想要建造一艘萬噸巨輪一樣，簡直就是癡心妄想。
曾凡開著野馬直接到了實驗室樓下，實驗室共有七層，頂層是超算機房，布萊頓的實驗室和辦公室都在在二樓。
進入他辦公室的時候，布萊頓正坐在辦公桌前的椅子上，麵對著窗台上一盆仙人掌在發呆，亂糟糟的頭發和胡子不知道多久沒有打理了。
“布萊頓教授，有什麽進展嗎？”曾凡拉過一把椅子，坐在他的辦公桌旁邊。
“沒有，我們的設想很好，理論上麵也沒問題，隻是目前還沒有找到正確的方式，不知道什麽時候能成功！”布萊頓對他到來一點也不奇怪，繼續盯著仙人掌發呆。
曾凡的設想就是改造出一種噬菌體，作為基因剪刀，利用它們的自有能力，攜帶指定的基因片段，插入想要編輯的目標基因組中。
噬菌體按照對細菌的殺傷力分為毒性噬菌體和溫和型噬菌體，毒性噬菌體進入所克製的細菌體內就會瘋狂的自我複製，達到一定數量就會分解一種酶，裂解宿主細菌；溫和型噬菌體不同，進入宿主細菌後，會將自身基因整合到細菌染色體上，跟隨細菌一起繁殖，在達到某些特定條件才會裂解宿主細菌，重新尋找宿主。
他們的設想就是利用這種溫和型噬菌體的特性，進行基因插入，從而實現對目標基因組的編輯。
可是噬菌體都是專門針對某一類細菌進行入侵，體型太小，想將固定基因和它們融合也很難，尤其是後麵一個難點，布萊頓研究半年也沒找到一個好辦法。
麵前的桌子上放著厚厚一摞文件夾，曾凡隨手拿起最上麵一本翻看，是一本實驗記錄。
布萊頓的一個助手進行的一次新型噬菌體實驗，他們在研究一種針對藍莓樹致病細菌的噬菌體，這次實驗以失敗告終，這種噬菌體入侵目標細菌後並不能大量繁殖，反而是肉包子打狗，有去無迴。
在顯微鏡下的觀察顯示，這些噬菌體進入目標細菌後，自身基因被某種物質切斷，等於被人家打了埋伏，一進去就被消滅掉了。
尤其是電鏡拍攝的照片顯示，噬菌體的堿基序列被切斷的位置非常整齊，都在某一個固定的位置被切斷，好像是一群被斬首示眾的土匪。
“布萊頓教授，這次實驗前在細胞一號上麵進行過模擬驗證嗎？”曾凡將實驗記錄放到他麵前問道。
“這是臨時增加的實驗，沒有進行驗證，不過我們做過這種病菌的基因組測序，進行驗證難度不大，這報告有什麽不對嗎？”布萊頓問道。
“病菌能將噬菌體基因在同一位置切斷，那麽它們應該有方法判斷噬菌體的基因序列，然後才好下刀，這不正是我們需要的剪刀嗎？”
他的話瞬間引起布萊頓的興趣，拿起文件夾仔細觀察那些拍攝的照片，越看越覺得曾凡說的有道理，然後拿著文件夾急匆匆跑了出去。
“瑞恩！瑞恩！五十九號實驗的樣品還在嗎？”布萊頓出門跑到不遠的一間實驗室喊道。
“教授，剛剛處理完！”一頭棕色自然卷發型的年輕助手聳聳肩迴答道。
“那你重新準備材料，重複這個實驗，最後的照片多拍幾張，看看結果是不是相同！”布萊頓吩咐道。
“遵命，先生！”
隨後，布萊頓拉著曾凡乘電梯上頂樓的機房，準備進行一次這個實驗的演化模擬，看看能不能複現實驗中的情況。
機房中一身白大褂的黛西正坐在超算控製台前麵觀看屏幕上的模擬畫麵，整天觀看類似畫麵的曾凡一眼就看出這是什麽場景。
這是細胞分裂的場景，她們不是一直在研究病菌和噬菌體嗎，怎麽研究起多細胞生物了，曾凡有點納悶，這種演化模擬都很費時間。
“黛西，你的牛皮蠅模擬還要多長時間？我們要做五十九號實驗演化模擬！”布萊頓拉開椅子坐在她身邊。
“我也不知道，才剛開始一天，還在胚胎發育期，我可以暫停讓給你先做！”黛西轉頭看見曾凡站在身後，笑著打招唿。
“曾，你可是有一個月沒過來了！我們的細胞一號什麽時候升級？”
“基因二號芯片量產出來就升級，下個月應該差不多了，我們實驗室當然要擁有最強超算！”曾凡迴答道。
畢業於普林斯頓的黛西今年三十二歲，留校當了三年助教，去年評副教授失敗，經過帕米拉的介紹來到貝拉農場實驗室，繼續自己的研究。
曾凡將黛西當前的模擬程序暫停存盤，然後根據布萊頓的提示操作調出實驗菌的基因組序列，使用工具軟件進行演化程序製作。
為了方便他們進行不同菌種的演化模擬，曾凡專門改寫了個工具軟件，隻要有細菌或者噬菌體的基因組序列，就能根據已知數據自動生成模擬程序，極大的降低了他們自己操作的難度。
曾凡沒時間總在這裏，薛燕開學後也隻有周末能過來，有了這個工具軟件，他們就方便多了，每次實驗前先進行幾次模擬，效率能提高很多。
“黛西，你這個模擬程序也是用工具軟件自動生成的嗎？”曾凡好奇的問，這個軟件是在之前的基礎上進行了專門對細菌微生物的優化，牛皮蠅這種他見都沒見過的物種不知道準確度能有多少。
“是啊，你寫的工具軟件挺好用，這麽複雜的昆蟲一個多小時程序就完成了，我添加了一些特征參數就開始演化模擬，今天一整天都沒有出錯，可能有你之前果蠅的模擬的數據積累吧，畢竟都是蠅類！”黛西說道。
細菌類單細胞生物基因組都很簡單，生成速度很快，幾分鍾就完成了，立刻開始演化模擬。