紐約中央公園的麵積超過五千畝,除了大量各種綠色植物外,還有大小五個湖泊,酒吧,動物園,露天劇院,多個小型運動場,隨處可見的休息長椅,最大的特點就是完全免費,早上六點到晚上十二點,任何人都可以隨意出入。
跑步的同時,曾凡也算走馬觀花的遊覽了一遍,總共花了四十多分鍾才迴到酒店。
剛洗完澡換上衣服,房間的門就被敲響了,帕米拉喊他一起下樓吃早餐。
黃世傑被弗蘭克委派招待他們,早早的就過來了,吃完早餐稍微休息了一會,步行去實驗室,開始正式的交流。
除了黃世傑他們十二個今年新招的有計算機特長的博士生外,實驗室還有生物遺傳相關專業的研究員和博士生二十幾個,還有一些算是兼職的本科生,做一些輔助工作。
一頭白發的弗蘭克老頭率領實驗室眾多門生弟子迎接他們到來,和自己青出於藍的弟子帕米拉熱情擁抱簡單的交流了幾句,隨後又滿麵笑容的和曾凡打招唿,用熱情洋溢的誇張言辭稱讚了他一番的成就,誇得曾凡都有點忍不住撓頭,這說的是我嗎?
接下來又挨個為他們介紹實驗室的眾人,難為老頭了,在他嘴裏都是難得的英才,每個人都身負絕技,做出過了不起的成績。
這老頭的口才讓曾凡想起小時候趕集遇到的賣萬能膠,切菜刀的那些人才,那真是舌綻蓮花,出口成章,還是一套接一套的詞,合轍押韻朗朗上口,讓你不得不佩服。
當然,這裏是嚴肅的科研機構,寒暄過後還是要進入正題,在會議室開始討論他們的項目。
實驗室這麽多人,主要分成兩大部分,一部分是弗蘭克原班人馬,都是生物學相關專業,過去也一直從事相關研究,他們主要負責模擬程序需要的數據收集,以及後續基因功能驗證的工作;剩下的一部分人就是新招的黃世傑為首的這些原先計算機相關專業的博士生,他們就是負責將酵母菌基因功能演化模擬程序升級到更複雜的岡比亞蚊模擬程序,利用學校的超級計算機進行模擬演化操作。
看來,弗蘭克為了在基因功能模擬演化這方麵有所作為,也是下了很大決心,一下子招這麽多人,做不出成績來,不僅會影響學生畢業,到時候對他的聲譽也有很大打擊。
他諮詢過學校計算機專業的教授,已經意識到程序的複雜性,所以才一下子招收這麽多有經驗的博士生,酵母菌基因功能演化模擬成功讓他有點低估了升級程序的難度,直到一個多月程序毫無進展,才讓他察覺到自己的錯誤,好在還來得及彌補。
幾個資深研究員先介紹了他們在岡比亞蚊基因組數據方麵做的準備,已經確認了多少個基因的功能,正在進行著多少組實驗,還有哪些基因功能在測試之中等等。
隨後,黃世傑代表程序小組講述了程序升級的進展,目前遇到的困難,需要得到哪方麵的幫助等等。
他顯然還沒來的及獲得弗蘭克教授的真傳,講述過程幹巴巴,修飾詞很少,目前的進展就是幾乎毫無進展,前麵的都是困難,不知道該如何下手。
雖然編程使用的都是點點網絡開源的開發環境,使用的語言也是最基礎的c語言,可是程序結構和算法卻和以往的程序有了很大的改變,無論是基因函數複雜到囉嗦的設定,還是幾十層嵌套的繁複結構,都能看的他們這些年輕力壯的程序員頭昏腦脹。
光是那些詳細的代碼注釋,如果單獨印成書都夠他們學上一年了。
更別說還要在這個基礎上升級成複雜幾十倍的程序,還要能運行起來,他們十幾個人有這個本事,都可以開發操作係統了。
就連和曾凡一起過來的帕米拉都是第一次了解到程序有這麽複雜,她不懂編程,隻是聽說自己收的這個便宜學生編程厲害,看他課餘時間完成這個程序好像沒用多久,以為他隻是天賦比較好,現在才意識到,不隻是天賦好的問題了,怕是天賦好到有點逆天啊!
大家都說完,都看向曾凡,第一次參加這樣的交流,為了顯得鄭重一點,曾凡特意帶著一個筆記本,記錄了他們發言的一些關鍵點,方便組織語言答複。
其實憑他的記憶力,完全沒有必要,可是人家在認真發言,自己什麽都不做好像不太好,所以才特意帶過來當作道具。
“程序設計的這麽複雜,也是不得已而為,我們對大部分的基因功能了解很膚淺,基因組中的堿基序列哪些有用,哪些沒用不明確的地方太多,所以我隻能把已知的信息全部疊加進去,盡量真實的還原基因演化的全過程!這也是為什麽隻能用超算才能模擬的原因,因為需要的並行算力太龐大,普通的服務器效率太低!”
“曾博士,程序的升級沒有更簡便快捷一點的方法嗎?”弗蘭克教授問道。
“當時沒想到這麽就要快模擬更高級的生物,提交源代碼的時候剛剛完成答辯,我們後續的項目還沒開始,所以後來寫的升級工具沒有發布,這次我一起帶過來了,不需要對原先的代碼有太深刻的理解,導入要升級物種的基因組序列,就可以自動生成所有基因函數,已知的基因功能代碼會自動添加進去,當然,模擬物種的一些其他數據也需要手動添加才行,物種未知基因越多,模擬運行的難度越大,我們黑腹果蠅項目的進展同樣也不是很順利!”
演講不是曾凡的特長,這些要說的話他提前都已經有了腹稿,在別人看來,就是一副胸有成竹的模樣。
黃世傑忍不住插言說道:“那我們現在就試試?”
“這裏麵是升級工具源代碼,你添加一些必要的參數信息,編譯後運行就可以!”曾凡從帶來的包裏麵掏出一張光盤在會議桌上遞給他。
升級工具的源代碼並不多,看上去也沒有模擬程序源代碼那麽複雜,黃世傑很輕鬆的就能看懂大部分代碼,讓他從頭編出一個相同程序好像也不太難。
前提就是他對整個模擬程序有足夠了解,還要對生物基因的演化過程有深刻的認識,再學幾年或許可以做到。
會議桌上麵的電腦桌麵直接投影到牆上的幕布,黃世傑熟練的操作電腦導入升級工具源代碼,在曾凡的提示下修改相關參數,編譯後運行。
打開了升級工具,依次選擇要升級的程序,要導入的生物基本信息,基因組數據源等等必要設置完後,提示是否確定升級?
跑步的同時,曾凡也算走馬觀花的遊覽了一遍,總共花了四十多分鍾才迴到酒店。
剛洗完澡換上衣服,房間的門就被敲響了,帕米拉喊他一起下樓吃早餐。
黃世傑被弗蘭克委派招待他們,早早的就過來了,吃完早餐稍微休息了一會,步行去實驗室,開始正式的交流。
除了黃世傑他們十二個今年新招的有計算機特長的博士生外,實驗室還有生物遺傳相關專業的研究員和博士生二十幾個,還有一些算是兼職的本科生,做一些輔助工作。
一頭白發的弗蘭克老頭率領實驗室眾多門生弟子迎接他們到來,和自己青出於藍的弟子帕米拉熱情擁抱簡單的交流了幾句,隨後又滿麵笑容的和曾凡打招唿,用熱情洋溢的誇張言辭稱讚了他一番的成就,誇得曾凡都有點忍不住撓頭,這說的是我嗎?
接下來又挨個為他們介紹實驗室的眾人,難為老頭了,在他嘴裏都是難得的英才,每個人都身負絕技,做出過了不起的成績。
這老頭的口才讓曾凡想起小時候趕集遇到的賣萬能膠,切菜刀的那些人才,那真是舌綻蓮花,出口成章,還是一套接一套的詞,合轍押韻朗朗上口,讓你不得不佩服。
當然,這裏是嚴肅的科研機構,寒暄過後還是要進入正題,在會議室開始討論他們的項目。
實驗室這麽多人,主要分成兩大部分,一部分是弗蘭克原班人馬,都是生物學相關專業,過去也一直從事相關研究,他們主要負責模擬程序需要的數據收集,以及後續基因功能驗證的工作;剩下的一部分人就是新招的黃世傑為首的這些原先計算機相關專業的博士生,他們就是負責將酵母菌基因功能演化模擬程序升級到更複雜的岡比亞蚊模擬程序,利用學校的超級計算機進行模擬演化操作。
看來,弗蘭克為了在基因功能模擬演化這方麵有所作為,也是下了很大決心,一下子招這麽多人,做不出成績來,不僅會影響學生畢業,到時候對他的聲譽也有很大打擊。
他諮詢過學校計算機專業的教授,已經意識到程序的複雜性,所以才一下子招收這麽多有經驗的博士生,酵母菌基因功能演化模擬成功讓他有點低估了升級程序的難度,直到一個多月程序毫無進展,才讓他察覺到自己的錯誤,好在還來得及彌補。
幾個資深研究員先介紹了他們在岡比亞蚊基因組數據方麵做的準備,已經確認了多少個基因的功能,正在進行著多少組實驗,還有哪些基因功能在測試之中等等。
隨後,黃世傑代表程序小組講述了程序升級的進展,目前遇到的困難,需要得到哪方麵的幫助等等。
他顯然還沒來的及獲得弗蘭克教授的真傳,講述過程幹巴巴,修飾詞很少,目前的進展就是幾乎毫無進展,前麵的都是困難,不知道該如何下手。
雖然編程使用的都是點點網絡開源的開發環境,使用的語言也是最基礎的c語言,可是程序結構和算法卻和以往的程序有了很大的改變,無論是基因函數複雜到囉嗦的設定,還是幾十層嵌套的繁複結構,都能看的他們這些年輕力壯的程序員頭昏腦脹。
光是那些詳細的代碼注釋,如果單獨印成書都夠他們學上一年了。
更別說還要在這個基礎上升級成複雜幾十倍的程序,還要能運行起來,他們十幾個人有這個本事,都可以開發操作係統了。
就連和曾凡一起過來的帕米拉都是第一次了解到程序有這麽複雜,她不懂編程,隻是聽說自己收的這個便宜學生編程厲害,看他課餘時間完成這個程序好像沒用多久,以為他隻是天賦比較好,現在才意識到,不隻是天賦好的問題了,怕是天賦好到有點逆天啊!
大家都說完,都看向曾凡,第一次參加這樣的交流,為了顯得鄭重一點,曾凡特意帶著一個筆記本,記錄了他們發言的一些關鍵點,方便組織語言答複。
其實憑他的記憶力,完全沒有必要,可是人家在認真發言,自己什麽都不做好像不太好,所以才特意帶過來當作道具。
“程序設計的這麽複雜,也是不得已而為,我們對大部分的基因功能了解很膚淺,基因組中的堿基序列哪些有用,哪些沒用不明確的地方太多,所以我隻能把已知的信息全部疊加進去,盡量真實的還原基因演化的全過程!這也是為什麽隻能用超算才能模擬的原因,因為需要的並行算力太龐大,普通的服務器效率太低!”
“曾博士,程序的升級沒有更簡便快捷一點的方法嗎?”弗蘭克教授問道。
“當時沒想到這麽就要快模擬更高級的生物,提交源代碼的時候剛剛完成答辯,我們後續的項目還沒開始,所以後來寫的升級工具沒有發布,這次我一起帶過來了,不需要對原先的代碼有太深刻的理解,導入要升級物種的基因組序列,就可以自動生成所有基因函數,已知的基因功能代碼會自動添加進去,當然,模擬物種的一些其他數據也需要手動添加才行,物種未知基因越多,模擬運行的難度越大,我們黑腹果蠅項目的進展同樣也不是很順利!”
演講不是曾凡的特長,這些要說的話他提前都已經有了腹稿,在別人看來,就是一副胸有成竹的模樣。
黃世傑忍不住插言說道:“那我們現在就試試?”
“這裏麵是升級工具源代碼,你添加一些必要的參數信息,編譯後運行就可以!”曾凡從帶來的包裏麵掏出一張光盤在會議桌上遞給他。
升級工具的源代碼並不多,看上去也沒有模擬程序源代碼那麽複雜,黃世傑很輕鬆的就能看懂大部分代碼,讓他從頭編出一個相同程序好像也不太難。
前提就是他對整個模擬程序有足夠了解,還要對生物基因的演化過程有深刻的認識,再學幾年或許可以做到。
會議桌上麵的電腦桌麵直接投影到牆上的幕布,黃世傑熟練的操作電腦導入升級工具源代碼,在曾凡的提示下修改相關參數,編譯後運行。
打開了升級工具,依次選擇要升級的程序,要導入的生物基本信息,基因組數據源等等必要設置完後,提示是否確定升級?