加州大學的超級計算機比加州理工的算力高了五倍左右，但是運行果蠅基因模擬演化程序仍然很吃力，因為總是在前麵就出錯停下，目前最長一次模擬也不過進行了十個小時。
模擬中的果蠅幼蟲還沒孵化出來就不得不結束，需要通過實驗補充新的數據，進行調整，然後重新開始模擬演化。
這個流程從五月一直重複到八月底，三個多月的時間，果蠅的幼蟲在計算機模擬程序中爬出來了。
顯示在屏幕上，就是一條不足十厘米的白色小肉蟲子，這還是為了方便觀察進行放大後的效果，它的實際尺寸隻有兩三毫米長。
農村長大的曾凡對這種蟲子很熟悉，夏天農村的廁所裏到處都是這種生物，它還有個通俗的名字，蛆。
為了模擬這個小玩意的誕生過程，他們兩個大學一百多人的團隊，忙碌了超過九十多天，盡管這隻是初步成功，也已經是很了不起的成就了。
“這個幼蟲胖乎乎的真可愛！”倪明明不知道什麽時候來到他的身後。
“可愛？一看你就是城市長大的孩子，如果你夏天的時候，在農村上過廁所，就不會這麽形容了！”曾凡意味深長的說道。
“它要多久變成會飛的果蠅？”倪明明不明白他的話，繼續問道。
“如果程序不出錯的話，需要超算連續不停的運行十天，不過不出錯的可能性不大，最多堅持三天，到了成蛹期肯定還會出錯的！”曾凡說道。
“可惜，我們新學期又要開學了，我是看不到了！”
“後麵的模擬進度估計會加快，等到你寒假過來的時候，或許整個模擬演化已經做完了，到時候你可以看到完成的過程！”
“模擬完果蠅，下一步你會模擬什麽動物？”
“如果我們自建的超算能如期完工的話，我希望能模擬小白鼠，不然的話，目前的算力，隻能繼續模仿類似的小型昆蟲或者單細胞生物！”
“等到我開始讀博，你是不是可以模擬人類基因組的演化過程了？”倪明明笑著說道，她對曾凡倒是信心十足。
“希望如此吧，不過，你要是提前畢業，那就夠嗆了！”
“得了吧，你以為人人都像你那麽變態，我能按時畢業就知足，我認識的同學已經轉學走了四五個了！”倪明明說道。
曾凡通過帕米拉實驗室的網絡連接加州大學超算中心進行模擬演化，他這裏隻相當於超算的一個終端機，前麵上下兩排六個液晶屏幕，顯示果蠅基因功能模擬程序的各部分重要數據變化，也可以根據需要切換顯示別的內容。
這時候正中央上方屏幕顯示的果蠅幼蟲停止爬動，翻了個身，肚皮朝上不動了。
下方屏幕彈出一個紅色錯誤提示框，這次模擬又出現錯誤，自動中止。
“又來活兒了，不過這次問題應該不大！”曾凡苦笑道。
“不打擾你工作，我下班了，拜拜！”倪明明從後麵拍拍他肩膀，背著一個雙肩包離開了。
曾凡查找錯誤原因，開始不知道進行了多少次的重複操作，整個程序就是在這樣一次次的錯誤中不斷完善進步。
每次報錯中止，意味著至少一個基因功能模擬錯誤，這些一般都是未知功能的基因，通過實驗驗證，往往就能發現這個基因的實際功能，哪怕隻能獲得部分數據，隻要程序能跳過這個錯誤，就能從後續模擬中獲得這個基因的更多數據，再通過實驗證實，一個重要的功能基因就又被發現，也意味著又可以發表一篇高質量論文。
雖然整個果蠅基因功能演化模擬進展緩慢，可是兩個大學的眾多參與人員已經發表了十幾篇相關論文，還有更多在醞釀之中，大家並沒有任何氣餒之心，好像在挖掘一個金礦，很多人還期待著能挖掘更長時間呢。
這個時候，曾凡和加州大學那邊的團隊將程序錯誤進行解讀分析，確定是哪個基因出錯，分配給相應小組進行實驗，在取得相應數據之前，模擬就暫時停止，超算讓給其他的團隊使用，他就可以去做別的事情了。
通常這個時候他就會離開實驗室，去圖書館看看最新的期刊，用來放鬆心情。
如果像今天這樣，時間比較晚了，那就提前迴去休息，上網玩會遊戲，逛逛論壇，收發下工作郵件，然後洗澡睡覺。
他和薛燕雖然注冊結婚了，並沒有天天住一起，薛燕大部分時間還是住在學校宿舍，他們更像一對學生情侶，仍然有各自的獨立空間，三五天沒有見麵都是正常現象，當然，每天都要進行例行的聯係。
在實驗室走廊，正遇到準備下班的帕米拉教授，兩人一起走樓梯下樓。
“我在哥倫比亞大學的導師弗蘭克教授發過來邀請，想請你過去做下交流，你感不感興趣？”
“就是他們實驗室上次準備和我們聯合研究，最後關頭又變卦吧？”曾凡問道。
“超算的使用也並不是他一個人能決定，他們學校的規模是我們十幾倍，在這方麵比我的權限要小得多！”帕米拉為自己的導師解釋道。
“我不抱成見，你如果希望我去，那我就去一趟，這次是他們獨立研究，我們學校不參與嗎？”曾凡問道。
“他們的超算最新完成升級，算力進入世界前十，弗蘭克教授的團隊準備模擬更複雜的岡比亞按蚊基因組演化過程，可是他們低估了程序的難度，進展很不理想，想請你過去幫忙找找原因，咱們學校你也知道，和加州大學的合作人手就已經不足了，分不出更多人參與！”帕米拉苦笑道。
“好吧，我考慮考慮，明天給你答複！”
這件事說完，他們正好走到實驗樓門口，各自上車離開。
西邊太陽已經落山，夜幕即將籠罩大地，曾凡將野馬停在房子車庫前的空地上，耿厲兩人的快餐車已經迴來了。
進入房子，薛燕也在，吳小林的女朋友艾倫也在，加上耿厲四個人正圍著餐桌吃飯，他再晚迴來一會，人家都吃完了。
看他進門，幾個人紛紛跟他打招唿。
“有沒有做我的份，我晚飯也沒吃呢？”曾凡問道。
“你那份被艾倫吃了，吃肉餅吧，蛋花湯還有你的份！”耿厲笑道。
“曾，對不起，還以為你又要加班呢！”艾倫趕忙表示歉意。
“沒關係，肉餅也一樣，能填飽肚子就行！”曾凡確實不講究這個。
同樣農村出來的耿厲做飯很是精打細算，總是想辦法避免浪費，無論是炒菜還是米飯饅頭，都要計算人頭，保證不會剩下太多，他通常都是最後一個吃完，盡量不留剩飯。
吃完飯大家在客廳看電視閑聊一會，先是單身一個人的耿厲迴自己房間了，然後薛燕示意曾凡上樓。
模擬中的果蠅幼蟲還沒孵化出來就不得不結束，需要通過實驗補充新的數據，進行調整，然後重新開始模擬演化。
這個流程從五月一直重複到八月底，三個多月的時間，果蠅的幼蟲在計算機模擬程序中爬出來了。
顯示在屏幕上，就是一條不足十厘米的白色小肉蟲子，這還是為了方便觀察進行放大後的效果，它的實際尺寸隻有兩三毫米長。
農村長大的曾凡對這種蟲子很熟悉，夏天農村的廁所裏到處都是這種生物，它還有個通俗的名字，蛆。
為了模擬這個小玩意的誕生過程，他們兩個大學一百多人的團隊，忙碌了超過九十多天，盡管這隻是初步成功，也已經是很了不起的成就了。
“這個幼蟲胖乎乎的真可愛！”倪明明不知道什麽時候來到他的身後。
“可愛？一看你就是城市長大的孩子，如果你夏天的時候，在農村上過廁所，就不會這麽形容了！”曾凡意味深長的說道。
“它要多久變成會飛的果蠅？”倪明明不明白他的話，繼續問道。
“如果程序不出錯的話，需要超算連續不停的運行十天，不過不出錯的可能性不大，最多堅持三天，到了成蛹期肯定還會出錯的！”曾凡說道。
“可惜，我們新學期又要開學了，我是看不到了！”
“後麵的模擬進度估計會加快，等到你寒假過來的時候，或許整個模擬演化已經做完了，到時候你可以看到完成的過程！”
“模擬完果蠅，下一步你會模擬什麽動物？”
“如果我們自建的超算能如期完工的話，我希望能模擬小白鼠，不然的話，目前的算力，隻能繼續模仿類似的小型昆蟲或者單細胞生物！”
“等到我開始讀博，你是不是可以模擬人類基因組的演化過程了？”倪明明笑著說道，她對曾凡倒是信心十足。
“希望如此吧，不過，你要是提前畢業，那就夠嗆了！”
“得了吧，你以為人人都像你那麽變態，我能按時畢業就知足，我認識的同學已經轉學走了四五個了！”倪明明說道。
曾凡通過帕米拉實驗室的網絡連接加州大學超算中心進行模擬演化，他這裏隻相當於超算的一個終端機，前麵上下兩排六個液晶屏幕，顯示果蠅基因功能模擬程序的各部分重要數據變化，也可以根據需要切換顯示別的內容。
這時候正中央上方屏幕顯示的果蠅幼蟲停止爬動，翻了個身，肚皮朝上不動了。
下方屏幕彈出一個紅色錯誤提示框，這次模擬又出現錯誤，自動中止。
“又來活兒了，不過這次問題應該不大！”曾凡苦笑道。
“不打擾你工作，我下班了，拜拜！”倪明明從後麵拍拍他肩膀，背著一個雙肩包離開了。
曾凡查找錯誤原因，開始不知道進行了多少次的重複操作，整個程序就是在這樣一次次的錯誤中不斷完善進步。
每次報錯中止，意味著至少一個基因功能模擬錯誤，這些一般都是未知功能的基因，通過實驗驗證，往往就能發現這個基因的實際功能，哪怕隻能獲得部分數據，隻要程序能跳過這個錯誤，就能從後續模擬中獲得這個基因的更多數據，再通過實驗證實，一個重要的功能基因就又被發現，也意味著又可以發表一篇高質量論文。
雖然整個果蠅基因功能演化模擬進展緩慢，可是兩個大學的眾多參與人員已經發表了十幾篇相關論文，還有更多在醞釀之中，大家並沒有任何氣餒之心，好像在挖掘一個金礦，很多人還期待著能挖掘更長時間呢。
這個時候，曾凡和加州大學那邊的團隊將程序錯誤進行解讀分析，確定是哪個基因出錯，分配給相應小組進行實驗，在取得相應數據之前，模擬就暫時停止，超算讓給其他的團隊使用，他就可以去做別的事情了。
通常這個時候他就會離開實驗室，去圖書館看看最新的期刊，用來放鬆心情。
如果像今天這樣，時間比較晚了，那就提前迴去休息，上網玩會遊戲，逛逛論壇，收發下工作郵件，然後洗澡睡覺。
他和薛燕雖然注冊結婚了，並沒有天天住一起，薛燕大部分時間還是住在學校宿舍，他們更像一對學生情侶，仍然有各自的獨立空間，三五天沒有見麵都是正常現象，當然，每天都要進行例行的聯係。
在實驗室走廊，正遇到準備下班的帕米拉教授，兩人一起走樓梯下樓。
“我在哥倫比亞大學的導師弗蘭克教授發過來邀請，想請你過去做下交流，你感不感興趣？”
“就是他們實驗室上次準備和我們聯合研究，最後關頭又變卦吧？”曾凡問道。
“超算的使用也並不是他一個人能決定，他們學校的規模是我們十幾倍，在這方麵比我的權限要小得多！”帕米拉為自己的導師解釋道。
“我不抱成見，你如果希望我去，那我就去一趟，這次是他們獨立研究，我們學校不參與嗎？”曾凡問道。
“他們的超算最新完成升級，算力進入世界前十，弗蘭克教授的團隊準備模擬更複雜的岡比亞按蚊基因組演化過程，可是他們低估了程序的難度，進展很不理想，想請你過去幫忙找找原因，咱們學校你也知道，和加州大學的合作人手就已經不足了，分不出更多人參與！”帕米拉苦笑道。
“好吧，我考慮考慮，明天給你答複！”
這件事說完，他們正好走到實驗樓門口，各自上車離開。
西邊太陽已經落山，夜幕即將籠罩大地，曾凡將野馬停在房子車庫前的空地上，耿厲兩人的快餐車已經迴來了。
進入房子，薛燕也在，吳小林的女朋友艾倫也在，加上耿厲四個人正圍著餐桌吃飯，他再晚迴來一會，人家都吃完了。
看他進門，幾個人紛紛跟他打招唿。
“有沒有做我的份，我晚飯也沒吃呢？”曾凡問道。
“你那份被艾倫吃了，吃肉餅吧，蛋花湯還有你的份！”耿厲笑道。
“曾，對不起，還以為你又要加班呢！”艾倫趕忙表示歉意。
“沒關係，肉餅也一樣，能填飽肚子就行！”曾凡確實不講究這個。
同樣農村出來的耿厲做飯很是精打細算，總是想辦法避免浪費，無論是炒菜還是米飯饅頭，都要計算人頭，保證不會剩下太多，他通常都是最後一個吃完，盡量不留剩飯。
吃完飯大家在客廳看電視閑聊一會，先是單身一個人的耿厲迴自己房間了，然後薛燕示意曾凡上樓。