京通倉的儲糧被盜賣近四百萬石，這事可不是小事，在朱載坖的嚴令之下，三法司和廠衛開始嚴審涉案的這些人員，要求他們退出贓款，朱載坖可沒有這個耐心，直接下令將涉案的小吏、奸商、官員全部抄家，男丁遣戍，女的送教坊司，他們是太平日子過久了，不知道廠衛是幹什麽吃的了。
當然也有部分官員認為朱載坖這次誅戮太過，上疏勸諫朱載坖，認為聖君治國，應以仁恕為本，要求朱載坖對這些人予以寬大處理，對於這些奏疏，朱載坖隻是禦批了一句，卿當太祖成祖時上此疏也！
有種你在朱重八和朱老四在位的時候去說這件事，看他們賞不賞你。
不僅如此，朱載坖很清楚，他們貪墨的遠遠不止四百萬石的儲糧，曆年以來他們貪墨之數，不知道是多少倍於四百萬石，不僅僅如此，倉場中的一些弊端也在嚴查之下被暴露出來。
在整個漕運的過程中，受盤剝最重的就是運軍，運軍到達張家灣時，當地太監則強行給予他們布囊，讓他們裝米運 上太監所造的剝船剝運糧食，並趁機索要錢財。在各閘壩剝運時，因有經紀把持，如果不交納足夠的錢財，則故意拖延刁難。在京通二倉，從官吏直到軍鬥諸役，留難需索，蠡弊多端。
在這種情況下，運軍大量逃亡，漕運難以為繼，各地漕運官軍起運漕糧抵達京通後，飽受各級官吏的勒索，不得不窮其所有甚至借債，以滿足貪官汙吏的苛剝從而完成漕運任務，大量的軍士因此破產逃亡。
根據王國光等人的調查，運軍繳納漕糧，有部司之投批，有科道之掛號，有倉庫之候收，各衙門逐一送驗，胥吏需索百端，守候常至半月。倉場附近還有大量被這些小吏豢養的流氓，他們三五成群，專恃倉場收放，以為營生，號為樓扒，或稱為光棍，或作為小腳等項名色，出入倉場，勢如狼虎，榨取人財。是以收放之際，被其攪擾。
朱載坖這次整頓倉場，連他們也一道抓捕了，朱載坖下令，其中民憤大，惡行深的，就地正法，其餘的這些流氓，一律罰作苦役，去疏浚通惠河，保證京通倉漕糧的運輸。
當然，朱載坖在大刀闊斧的整頓倉場的時候，這幫人也不會坐以待斃的，不少漏網之魚開始在京城散布謠言，說朝廷已經無米發給京營士卒了，說京通倉是空的，一時之間流言四起，京城米價陡然上漲。
麵對這種形勢，朱載坖一方麵嚴令錦衣衛、五城兵馬司在京城緝拿造謠生事的人，一方麵從京通倉調運糧食，出粟平價，以紓民急，同時朱載坖還派人與李朝觀等人溝通，要求京師的糧商不準隨意漲價，作為迴報，朱載坖會增加今歲開中鹽引的數額，在多種手段之下，盡管這次引發了一些波瀾，但是很快就被壓下去了。
而經過廠衛的三法司的審理，此案也很快告一段落，在朱載坖要求嚴厲追贓的指示下，這次倉場弊案的追贓數字創下了大明的記錄，廠衛抄家達到五百餘家，籍沒的財產折合銀兩高達二百二十萬兩，還有從這些不法糧商手中追繳的儲糧一百九十萬石。
朱載坖下令，拿出一部分到東南、湖廣購買糧食，補足賬麵八百餘萬石的儲糧，再將今年的京運年例銀發給九邊，同時補充了一部分往年欠發的軍餉。
而對於這些貪贓的小吏和奸商，三法司除了數額特別巨大的要求斬立決之外，剩餘的都是擬的遣戍，朱載坖將三法司所擬定的判詞駁迴，明確要求，貪墨千兩以上的絞，貪墨三千兩以上的斬，一應奸商，全部斬立決。
刑部尚書黃光昇向朱載坖上疏，認為這樣殺人太多，有傷天和，請求朱載坖寬恩減罪一等，朱載坖將黃光昇訓斥罰俸，要求奉詔擬來勾決，除主犯在京師正法之外，剩餘的罪囚，全部送京通倉正法，著京通倉全體官吏觀刑。
在血淋淋的屠刀之下，京通倉新上任的這些官吏們終於知道朱載坖不是開玩笑的，當然朱載坖也很清楚，僅僅靠殺人是解決不了貪墨問題的，要是殺人能禁止貪墨的話，那老朱就禁絕貪墨的，尤其是倉場這種地方，天量的錢糧在此儲積，而這幫小吏的工食銀又極少，他們不去盜賣儲糧才是怪事了。
經過和內閣、王國光等人的商量，朱載坖也增加了京通倉小吏的工食銀，經過這次增加之後，即便是最底層的書吏，每月俸銀加上工食銀時二兩，再加上月糧本色一石五鬥，足夠一家人過上相對富足的生活了。
同時運軍的待遇也要增加，在朱載坖的直接幹預下，運軍運輸漕糧的兩月，除了月糧和行糧之外，額外發給二兩餉銀，但是同時也要求運軍不得在路上拖延，必須盡快將漕糧運輸到京通倉繳納，同時在繳納漕糧的時候，都察院派出禦史臨場監督，有弄虛作假和欺壓運軍的，禦史當即處置。
同時朱載坖還要求河漕總督朱衡保證漕渠暢通，嚴禁隨意改兌，朱載坖嚴斥戶部：漕運糧米，歲有常數，係祖宗成法。即遇災傷，自有蠲省常便。近來內外官奏免，任意紛更。該部一概題複，不聞執奏，坐損國儲，是何道理？嗣後概不許改折漕糧，四百萬本色，務必實貯，以為軍國之用也！
朱載坖即位以來掀起的第一件大案，倉場弊案，就算是到此落下帷幕，朱載坖隨後開始自己即位以來心心念念的一件事情，就是南兵北調，尤其是戚繼光部的北調，現在東南的倭寇稍微有所收斂，朱載坖決定將戚繼光及所部戚家軍調至薊鎮來，用以拱衛京師。
朱載坖向內閣透露了這個想法，但是遭到了徐階等人的反對，兵部尚書江東也不支持調南兵北上。
當然也有部分官員認為朱載坖這次誅戮太過，上疏勸諫朱載坖，認為聖君治國，應以仁恕為本，要求朱載坖對這些人予以寬大處理，對於這些奏疏，朱載坖隻是禦批了一句，卿當太祖成祖時上此疏也！
有種你在朱重八和朱老四在位的時候去說這件事，看他們賞不賞你。
不僅如此，朱載坖很清楚，他們貪墨的遠遠不止四百萬石的儲糧，曆年以來他們貪墨之數，不知道是多少倍於四百萬石，不僅僅如此，倉場中的一些弊端也在嚴查之下被暴露出來。
在整個漕運的過程中，受盤剝最重的就是運軍，運軍到達張家灣時，當地太監則強行給予他們布囊，讓他們裝米運 上太監所造的剝船剝運糧食，並趁機索要錢財。在各閘壩剝運時，因有經紀把持，如果不交納足夠的錢財，則故意拖延刁難。在京通二倉，從官吏直到軍鬥諸役，留難需索，蠡弊多端。
在這種情況下，運軍大量逃亡，漕運難以為繼，各地漕運官軍起運漕糧抵達京通後，飽受各級官吏的勒索，不得不窮其所有甚至借債，以滿足貪官汙吏的苛剝從而完成漕運任務，大量的軍士因此破產逃亡。
根據王國光等人的調查，運軍繳納漕糧，有部司之投批，有科道之掛號，有倉庫之候收，各衙門逐一送驗，胥吏需索百端，守候常至半月。倉場附近還有大量被這些小吏豢養的流氓，他們三五成群，專恃倉場收放，以為營生，號為樓扒，或稱為光棍，或作為小腳等項名色，出入倉場，勢如狼虎，榨取人財。是以收放之際，被其攪擾。
朱載坖這次整頓倉場，連他們也一道抓捕了，朱載坖下令，其中民憤大，惡行深的，就地正法，其餘的這些流氓，一律罰作苦役，去疏浚通惠河，保證京通倉漕糧的運輸。
當然，朱載坖在大刀闊斧的整頓倉場的時候，這幫人也不會坐以待斃的，不少漏網之魚開始在京城散布謠言，說朝廷已經無米發給京營士卒了，說京通倉是空的，一時之間流言四起，京城米價陡然上漲。
麵對這種形勢，朱載坖一方麵嚴令錦衣衛、五城兵馬司在京城緝拿造謠生事的人，一方麵從京通倉調運糧食，出粟平價，以紓民急，同時朱載坖還派人與李朝觀等人溝通，要求京師的糧商不準隨意漲價，作為迴報，朱載坖會增加今歲開中鹽引的數額，在多種手段之下，盡管這次引發了一些波瀾，但是很快就被壓下去了。
而經過廠衛的三法司的審理，此案也很快告一段落，在朱載坖要求嚴厲追贓的指示下，這次倉場弊案的追贓數字創下了大明的記錄，廠衛抄家達到五百餘家，籍沒的財產折合銀兩高達二百二十萬兩，還有從這些不法糧商手中追繳的儲糧一百九十萬石。
朱載坖下令，拿出一部分到東南、湖廣購買糧食，補足賬麵八百餘萬石的儲糧，再將今年的京運年例銀發給九邊，同時補充了一部分往年欠發的軍餉。
而對於這些貪贓的小吏和奸商，三法司除了數額特別巨大的要求斬立決之外，剩餘的都是擬的遣戍，朱載坖將三法司所擬定的判詞駁迴，明確要求，貪墨千兩以上的絞，貪墨三千兩以上的斬，一應奸商，全部斬立決。
刑部尚書黃光昇向朱載坖上疏，認為這樣殺人太多，有傷天和，請求朱載坖寬恩減罪一等，朱載坖將黃光昇訓斥罰俸，要求奉詔擬來勾決，除主犯在京師正法之外，剩餘的罪囚，全部送京通倉正法，著京通倉全體官吏觀刑。
在血淋淋的屠刀之下，京通倉新上任的這些官吏們終於知道朱載坖不是開玩笑的，當然朱載坖也很清楚，僅僅靠殺人是解決不了貪墨問題的，要是殺人能禁止貪墨的話，那老朱就禁絕貪墨的，尤其是倉場這種地方，天量的錢糧在此儲積，而這幫小吏的工食銀又極少，他們不去盜賣儲糧才是怪事了。
經過和內閣、王國光等人的商量，朱載坖也增加了京通倉小吏的工食銀，經過這次增加之後，即便是最底層的書吏，每月俸銀加上工食銀時二兩，再加上月糧本色一石五鬥，足夠一家人過上相對富足的生活了。
同時運軍的待遇也要增加，在朱載坖的直接幹預下，運軍運輸漕糧的兩月，除了月糧和行糧之外，額外發給二兩餉銀，但是同時也要求運軍不得在路上拖延，必須盡快將漕糧運輸到京通倉繳納，同時在繳納漕糧的時候，都察院派出禦史臨場監督，有弄虛作假和欺壓運軍的，禦史當即處置。
同時朱載坖還要求河漕總督朱衡保證漕渠暢通，嚴禁隨意改兌，朱載坖嚴斥戶部：漕運糧米，歲有常數，係祖宗成法。即遇災傷，自有蠲省常便。近來內外官奏免，任意紛更。該部一概題複，不聞執奏，坐損國儲，是何道理？嗣後概不許改折漕糧，四百萬本色，務必實貯，以為軍國之用也！
朱載坖即位以來掀起的第一件大案，倉場弊案，就算是到此落下帷幕，朱載坖隨後開始自己即位以來心心念念的一件事情，就是南兵北調，尤其是戚繼光部的北調，現在東南的倭寇稍微有所收斂，朱載坖決定將戚繼光及所部戚家軍調至薊鎮來，用以拱衛京師。
朱載坖向內閣透露了這個想法，但是遭到了徐階等人的反對，兵部尚書江東也不支持調南兵北上。